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注册50万的公司需要缴纳的税款金额并不是固定的，因为税款金额取决于公司的营业额、利润、税种和税率等因素。以下是公司需要缴纳的一些常见税种及其大致的税率范围。
1、增值税：根据销售额计算，一般纳税人的税率有17%、13%、11%、6%等档次，如果是服务行业，税率一般为6%或3%（小微服务企业的税收优惠政策），如果是销售商品的公司，增值税税率为销售额的17%，假设销售额为50万，不含税销售额则为约34万（假设税率为含税率），根据销售额计算增值税额，具体税额需要根据实际销售额计算。
2、企业所得税：根据公司的利润计算，税率为利润的25%（非高新技术企业的所得税税率），如果公司年应纳税所得额不超过30万，税率为实际利润的最低税率（通常为较低的税率），如果公司注册后没有实际业务或利润为零，则不需要缴纳企业所得税，如果公司有盈利，则需要按照相应的税率缴纳企业所得税，具体税额取决于公司的利润情况。
除了上述税种外，公司还可能涉及印花税、房产税等其他税种，无法准确计算注册50万的公司需要缴纳多少税款，需要根据公司的具体情况进行综合考虑，建议咨询专业的会计师或税务师以获取更准确的税务计算和指导。